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生科院腊红桂课题组在《Theoretical and Applied Genetics》发表水稻粒长和产量调控基因的图位克隆研究成果

发布时间:2024年01月24日 16:43 | 编辑:李娜 | 作者:

水稻产量育种一直在水稻育种领域占有核心的地位。水稻的产量主要是由千粒重、穗粒数、单株穗数所决定。因此,寻找决定这些性状的优良基因资源、并解析它们之间的相互关系,已经成为水稻分子育种领域的研究热点。自然变异基因往往蕴含着重要的育种价值,所以,发掘和利用自然变异基因,并解析它们在产量形成中的调控作用,是提升水稻产量的重要途径。2024120号,国际知名植物分子遗传和分子育种期刊Theoretical and Applied Genetics (TAG) 在线发表了美高梅mgm1888网站腊红桂课题组的水稻粒长和产量调控基因的图位克隆研究成果。

本研究以水稻自然变异品种旱稻385为实验材料,该品种的粒长和粒宽都明显大于一般品种和模式品种日本晴。采用图位克隆策略,把决定粒长的主效基因位点(QTL)定位于3号染色体上,并被命名为IGL1Increased Grain Length 1)。利用BC3F2群体进行的精细定位把IGL1定位于大约70.8 kb的区间,该区间包含9ORFs。通过筛选该区间内的基因,最终确定了ORF6 (LOC_Os03g30530) 是可能的目标基因。随后,通过互补和基因敲除实验证明了该基因确实对应于IGL1。序列分析表明,与中等粒长的日本晴品种相比,来自旱稻385”igl1HD385等位基因含有一个氨基酸转换和一个氨基酸丢失,表明了该基因在旱稻385”中确实发生了自然变异。进一步分析表明,igl1HD385是一个半显性突变。当把igl1HD385等位基因渗入到日本晴背景下,显著地提高了它的粒长和千粒重,这显示了该等位基因有潜在的育种应用价值。目前的研究表明,IGL1与几个重要的转录因子之间有相互关系,是一个水稻粒长和千粒重的重要调节子。相关的分子机制研究还在继续进行当中。

该项目由江苏省农业自主创新项目、江苏省自然科学基金项目支持。美高梅mgm1888网站博士生牛佳宇是论文的第一作者,腊红桂和陈虎辉为共同通讯作者。(全文链接:https://doi.org/10.1007/s00122-023-04531-7


A: 旱稻385”(HD385) 日本晴(NIP) 的粒长比较

B: IGL1被定位于3号染色体

C: IGL1的精细定位,IGL1被确认对应于ORF6,位于70.8-kb的区间

D: IGL1旱稻385”日本晴之间的碱基变异

E: igl1HD385等位基因被渗入日本晴背景后对粒长的影响

 

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